Что будет, если опоздать на рейс в крайний день визы и из-за этого задержаться в зоне Шенгена? И что, если, по причине авиакомпании рейс перенесут, например, на другой день?)

Ничего/штраф/запрет на въезд в Шенген, второе и третье может быть в комплекте

По причине АК бывает крайне редко. А по собственной безбашенности - штраф и бан на въезд в Шенген в будущем

Для этого есть коридор въезда и дни пребывания, запас дня /дней на выезд все умные люди имеют.

Если по причине авиакомпании то вам поставят штамп специальный и все ок будет. У меня у друга с кем летела так было во франкфурте. У меня была 5 летняя виза и мне без разницы было, а у него она заканчивалась в день вылета. В 23 аэропорт закрывался и мы не успели по вине аэрофлота вылететь. Точнее по вине аэропорта который не успел заправить самолет. Их офицеры таможни отвели куда то и поставили штампы специальные