Подскажите возвращаться из РБ в РФ для граждан Украины с ВНЖ в РФ только через Шереметьево? Или можно на поезде? Планирую туда ехать на поезде или тоже нужно самолетом, чтоб отметку поставили? На авто ехать не вариант.

У вас только один вариант: самолёт

Обратно в Россию - только самолёт и только через Шереметьево с повторным прохождением «фильтрации», если её не пройдёте - в Россию вас не пустят. Наличие ВНЖ РФ при прохождении «фильтрации» - привилегий не даёт, даже наоборот, поэтому, если вам есть что терять в России и планируете вернуться - подумайте хорошо: стоит ли вам вообще выезжать!