Подскажите, пожалуйста, если у меня белорусский паспорт с действующей итальянской визой, впустят ли меня в Эстонию через погранпереход "Куничина гора - Койдула"?

Вас должны впустить, ограничения для пасп рф Вас не касаются т.к для пасп рб свои ограничения (в основном - по выдаче виз). Изучите и выполняйте требования по вьезду и нахождению в ЭР, в частности по страховке и по наличным деньгам на время пребывания в ЭР.

Пустят.

Но будьте готовы к вопросам зачем , куда и для чего.

Не все погранцы в курсе, что белорусские страховки можно использовать. Один раз даже куда-то звонили. Но все разы с белорусской страховкой пропускали.