Я гражданин РФ, с мужем (гражданин Латвии) въедем в Латвию, далее я планирую полететь в Гамбург на 14 дней, смогут меня пустить на борт? Но я поеду одна, поэтому вопрос))

Сможете. Вы уже будете на территории ес, виза есть, значит легально. Можете свободно перемещаться на территории ес.

Вам главное попасть в Латвию. Проблем с перелетом в Гамбург из Латвии ни каких не будет. Не переживайте. Естественно при наличии ВНЖ или Шенгенской визы