Может кто-нибудь еще подскажет такой нюанс, мы прилетает в Осаку в 21 час, дальше планируем в Киото, но во многих отелях check inn до 00-00, есть вероятность, что мы не успеем (естественно если прилетим во время)?

А поезд до Киото в 22 будет (в такое время)? Проверьте расписание, может и не быть. На 1 час на выход надо закладывать точно и 50-60 минут на дорогу, если экспрессом, минут 40-50, но проверьте, ходит ли он.

Есть. Если будет много народу на паспортный контроль. Можете как вариант заранее на Трип ком купить билеты на харуку (там куар, надо будет в кассе обменять на билет), предварительно посмотрев расписание.

Сколько до Киото по времени с помощью Гугла и адреса вашей гостиницы.