Подскажите, пожалуйста, лучше самим взять машину и доехать до Иссык-Куль и до горячих источников или через туры?

Так это все на любителя -

через туры - вас и только вас посадят в машину и отвезут туда и обратно.

по дороге все расскажут и покажут. Ну и возьмут... вы уже видели сколько.

А можете сеть хоть на попутку,хоть на маршрутку и все сами.

тут как бы на выбор ваш все...