Подскажите, в загранпаспорте есть отчество только на кириллице? При покупке билета в Калининград отчество проставляется? И как пишется паспорт с пробелом или нет?

А там вроде без отчества заполняется

Заполняете сначала пассажиров. Там пишете данные пассажира все, как в паспорте. Программа автоматом делает транслитерацию отчества с кириллицы на латиницу.

Отчество в билете и в данных для запроса упрощенный проездной документ ЖД при покупке билета должно быть обязательно, если отчество у человека есть в обычном российском паспорте Номер паспорта подряд без пробела