Подскажите пожалуйста, если покупали готовый тур на Мальдивы со всеми перелетами и трансферами. И вдруг рейс задерживают, и в Мале не попадаешь во время, то трансфер новый надо ведь? Кто его бронирует и оплачивает? И один день в отели пропадает?

Нет ваш отель пришлет за вами трансфер с учетом вашего прибытия. Там дежурят представители отеля в аэропорту постоянно. Они в курсе задержек

Ваш турагент помогает вам разрешить ситуацию, иногда получается и отель идёт навстречу , и меняет даты и трансфер, иногда нет. Если вы сами то ваши приключения

Многое зависит от позиции непосредственно отеля к таким ситуациям, кто то клиенториентирован,а кто-то относится "ваши проблемы" и можно попасть на доп расходы на ночёвку в Мале и потерю суток в основном размещении. Это специфика направления.