Подскажите, пожалуйста! Гражданин РФ, есть ВНЖ иностранца в Казахстане. Можно ли оформить регистрацию по месту жительства (постоянная прописка) в РФ?

можно

Можно, у меня прописка и в РК, и в РФ.

Можно Получая ВНЖ или гражданство где бы то ни было вы по прежнему гражданин РФ поэтому имеете все права гражданина.