Подскажите как выгоднее: Везти с собой в Японию наличку в долларах и менять на месте или платить картой Армении ( евровый счет ) ?

Если Вы не живете в Армении, то наверняка за пополнение карты уже переплачиваете. С другой стороны, если летите из Японии в Россию, разрешается вывозить максимум 100 тыс йен.

По конвертации скорее всего немного выгоднее будут наличные доллары. По удобству - карта.

Ну и если обратно летите в РФ единым билетом, то больше 100000 йен нельзя вывезти по санкциям.