Если короткая пересадка в Шанхае одной авиакомпанией, нужно ли заполнять бумажки и сдавать отпечатки?

Тут может быть два варианта, непонятно куда вы летите, если в Китай, то нужно, если в другую страну и выходить из транзитной зоны не будете, то не нужно