Подскажите кто с Российским гражданством ездил в Прагу. Какие визы оформляли , через какие города ездили, как дешевле?

Это возможно только через любую страну Шенгена (кроме прибалтов, не пустят) , про чешские визы можно забыть. Дешевле - Москва-Рига на перевозчике, можно найти 120 евро, из Риги, муторно, на автобусе. Но в любом случае в Вашем варианте только через Париж, Рим или Мадрид. Дёшево не будет.