В Светлогорск погулять самостоятельно откуда посоветуете ехать, из Калининграда или из Зеленоградска? Логистика откуда проще будет?

Без разницы. Электрички и автобусы ходят.

Из Зеленоградска каждый час в 15 мин автобусы идут до Светлогорска, 582 и 587. И в Пионерский, и в Янтарный, и в Балтийск уехать можно. И ещё электрички ходят между этими городами (Зеленоградск-Пионерский-Светлогорск), но не так часто, как в Калининград.