Уточните пожалуйста, новый репатриант в Израиле если снимает отель должен ли платить налог 18%? или по истечении какого-то времени?

Вы становитесь гражданином в аэропорту. Граждане платят НДС 18%.

Вывод - платить придется сразу.

:(

Однозначно должен платить,у вас уже из аэропорта есть Теудат Зеут,вы гражданин,так что извольте.

спокойно идёте с своей Б2 визой, которую забыли у вас забрать и оформляетесь, как турист)

В теории да, так как вы гражданин. На практике можете показать форму с визой B2, что избавит вас от доплат. Разово