Что лучше сделать заранее перед поездкой в Японию? И скажите пожалуйста, какой примерно бюджет на двоих в среднем нужно в Японию?

бюджет для всех разный, смотря на сколько дней и где будете жить, в каких городах

100$ на человека в день

Если хотите посетить менее легкодоступные (чем просто на метро или поезде) или популярные места, то надо всё планировать и бронировать заранее, иногда за несколько месяцев до.