Я лечу из Таиланда, делала визу в Сингапур и лечу не транзитом, а на неделю.

Если у Вас будет виза в Сингапур, то, вообще, не имеет значения, куда Вы вылетаете после. Можете даже в ту же страну, откуда и прилетели. Необходимость вылет в 3-ю страну установлена только для безвизового транзита

Ничего не спросят) у вас же не транзит, а виза. Для въезда в Малайзию надо будет заполнить форму MDAC не ранее, чем за 3 дня. Можно и за 5 минут до пересечения границы Малайзии)