Подскажите, пожалуйста, последний раз была вторая подряд французская виза на пол года, но по ней во Францию съездить не удалось (есть штампы других стран ЕС, но штампов Франции нет), есть вероятность что при новой подаче - откажут ?

Вероятность отказа есть даже с Французскими штампами.

Зависит от кейса в целом и доли рандома

Наличие или отсутствие поездок во Францию не влияет, отказ можно получить и после правильно откатанной визы, и с чистым паспортом, и с поездками в Германию вместо Франции. Консул будет смотреть на все документы - ну и на своё настроение