Считается ли рейс транзитным, если я покупаю отдельно билет из Куала-Лумпура до Гуанчжоу, а оттуда уже вылет через +-30 часов до Москвы? Те это не готовый билет от авиакомпании, а два разных билета, которые планируем оплатить единоразово

Не важно, как вы билеты покупаете.

Транзитный не рейс, а маршрут. Для оформления безвизового транзита не имеет значения каких авиакомпаний у вас билеты и единые ли они. Значение имеетт:время пребывания в конкретном аэропорту. И количество пунктов пересадки в китае