Подскажите пожалуйста, летим из Северного Кипра с питомцем в салоне, все документы в порядке, прививки по графику и титры на бешенство есть, но после вывоза животного из России прошло более 90 дней, нужно ли заявление в Россельхознадзор?

Не нужно

Без справки не зарегистрироваться на рейс.

Вам нужно позвонить в Россельхознадзор. Скорее всего нужно будет оформлять сертификата вылет у них. Перед этим в ветклинику на обработку от паразитов с отметками в паспорте. Я вылетала с сертификатом турецким(ему было 94 дня с момента выдачи) без проблем.