При рассмотрении в консульстве Японии документов на получение однократной туристической визы в Японию, проверяет ли консул, что на текущий момент реально имеется на счете в банке заявленный в Справке остаток средств?

Нет, а как он может проверить? Банковская тайна, банки не имеют права разглашать такую информацию. Слышала о случаях, что когда приносили распечатанные выписки из приложения без живой печати, могли при подаче документов попросить зайти в приложение банка. Поэтому лучше подготовьте живую справку из банка с печатью и подписью

Никакой консул не может проверить, сколько у вас вот прямо сейчас денег на счету )