Подаюсь в Армении на шенген. Ходил в bls, сказали что нужно забрать все паспорта и действующие российские загранники и старые и даже второй загран, кто сталкивался? Это какие-то новые правила?

Да, забирают все паспорта. Если нужен второй загранник - нужно написать заявление с указанием причины почему не можете оставить второй паспорт и тогда его отдадут вам на руки. Заявление могут на месте за вас написать за доп.плату