Открыта испанская виза. Влетаю из Стамбула в Барселону. Через несколько дней лечу из Барселоны в Париж, (трансавиа). Проблем не будет? В аэропорту внутри шенгенской зоны вообще проверяют паспорта /визы?

Проверяют, но проблем быть не должно

А почему вообще должна быть проблема? У вас шенген и по нему можно перемещаться по Европе, без разницы где его выдали. Я только что подавался на Испанскую визу и в документах\билетах указал что несколько дней я в Испании потом несколько Германии - визу выдали

У Вас все нормально, потому что влетаете в ту страну, куда выдана виза. Дальше имеете право ехать по ЕС совершенно легально любым видом транспорта. Паспорта проверять могут для выдачи посадочного и при посадке в аэропорту, визу уже не смотрят. На автобусах смотрят билеты.

Бывают сейчас странные проверки в Германии например, но это исключения, а исключения могут возникнуть в любом случае, так никто не ответит