Вопрос к знающим. Могу ли я в Праге как физ лицо оказать разовую услугу? Т.е настроить сайт и выставить за это счет?

Там зависит от того как часто вы будете оказывать услуги и на какую сумму. Если будет разовая и меньше 50 тыс крон то можно. Если повторяется и сумма выше в год то надо открывать живность.