Если пополнять Белкарту Альфабанка по номеру карты с карты РФ банка мира, то все равно альфа банк будет пересчитывать по своему курсу по картам?

Вроде нет. Через некоторое время после перевода курс пересчитывается по ПС Мир

Верно. У них в правилах это прописано. По курсу МИР не пересчитывают, зачисляют по внутреннему курсу для карточек.