Смотрю билеты в ЮАР из Кейптауна до Москвы Qatar Airways с пересадкой в Йоханнесбурге и Дохе, и на трипе выдаёт, что в Йоханнесбурге нужно будет перерегистрировать багаж.

Катары не летают между городами ЮАР, поэтому это будет кодшэринг, то есть внутренний перелет будет НЕ катарами, поэтому в плане багажа тут все зависит от кодшерингового договора между катарами и внутренней АК.... Посмотрите офиц информацию на сайте катаров

Мы взяли такие на октябрь, катары через Доху, по багажу никаких уточнений, они сами его перегружают вроде

Билет катарами у вас только Йоханембург-Доха-Москва. А рейс до кейптауна - внутренние авиалинии. Поэтому багаж придется регать в Йоханнесбурге на рейс катаров и получите его уже в Москве.

Вы зайдите на сайт Катарских и попробуйте найти полет из Кейпа в Москву. Если предложится такой вариант, то нужно позвонить Катарам и спросить про багаж.

Если такой вариант там не предложиться, то значит это составной маршрут и стыковка на вашей отвественности со всеми вытекающими.

Не переживайте. Вы берете билет у катаров. Сначала из Кейпа до Джобурга летит внутренняя компания, скорее всего, сафэйр. Но вы сразу, в Кейпе говорите оформить багаж до Москвы, они вешают бирку транзит и сами перегружают багаж. Вы его получаете только в Москве. Кстати, в Джобурге катары могут задержать рейс (у нс задержали на 2 часа). Там критичнее в Дохе пересадка, там реально огромный аэропорт. Но мы успели. Оставался час до рейса на Москву.