Хочу заказать товар в Алматы с Ebay, цена 350$. Знаю, что нужно будет заплатить таможенный взнос.

В России таможенный сбор я оплачивал при получении, на почте.

А какой службой будет доставка? Можно попробовать позвонить им и узнать.

1) может тоже оплата пошлины при получении.

2) можно ли вернуть НДС и как это сделать.

Заказывали на 600 долларов, оплатили только то что на eBay показано было, никаких дополнительных таможенных сборов не платили, пришло на казпочту по адресу

Заказывал. Когда товар пришел на таможню со мной связался таможенный брокер (по телефону который я указал при оформлении заказа). Оплатил услуги брокера через Каспий(сумма не большая, точно не помню). Сам ничего больше не делал.

Заказ получил КазПочтой.