Надо ли сниматься с регистрации , имея ВНЖ в Казахстане, уезжая в РФ на несколько месяцев?

Нет. Более того, регистрация всегда должна быть.

Но надо соблюдать правило: проживать в РК не менее 183 дней за любые последовательные 12 месяцев, иначе аннулируют внж