Планирую путешествие с питомцем, вылет из Германии на Кипр евровингсом кота с полностью европаспортом, всеми прививками, чипированием и т. д.

По-хорошему ветконтроль должен работать 24/7, но это лучше уточнять в аэропорту. В других странах можно приехать туда за 48 часов до самолета. Моя собака так и делала

в аэропортах Германии на вылет нет ветконтролей. справки выдает ветамт.

но так как переезд внутри ЕС, то достаточно осмотра и печати в паспорт.