Подскажите, если из Турции в Иран на авто транзитом в Азербайджан поехать, визы на границе можно получить?

Почитайте правила въезда в Азербайджан. Сухопутные границы на въезд закрыты.

Из Грузии и России делают так - машину на автовоз (из Грузии гораздо дешевле), а сами самолётом. По идее можно и с Ирана, но как его в Иране искать я не знаю.

Для Ирана нужен будет карнет.