Подскажите пожалуйста, в рф какие органы нужно ставить в известность , что ты теперь гражданин Израиля?

Миграционный отдел МВД. Можно лично по месту жительства, можно через Госуслуги. В течение 60 дней с первого возвращения в РФ.