Подскажите пожалуйста кто проходил консульскую проверку на репатриацию в Израиль в Кишинёве? Как там консул и как лучше туда добраться из Москвы?

Там не один консул, а несколько.

В целом они лояльные, но еврейские корни, подтвержденные документами должны быть.

Добираться самолётом с пересадками. В Ереване например, или в Стамбуле.

Можете связаться с Фондом Дружбы. Они помогут с отелем в Кишиневе, и если захотите с билетом из Кишинева сразу в Израиль.