Подскажите пожалуйста, если есть знатоки острова Наксос, как там удобнее добираться из порта в посёлок Agia Anna?

На таких осровах обычно развито автобусное сообщение между портом и деревушками, там как правло несколько маршрутов, можно на найти на офиц сайте острова, такое есть, например, на Паросе и Антипаросе, а это соседние острова. Попробуйте посмотреть в гугл. Оплатить можно и водителю и заранее в офисе, но это не требуется.

Никогда не бывала на Наксосе, но судя по расписанию KTEL Наксоса, вот расписание от порта до Агиа Анны в мае.

С июня написано каждые полчаса с 7.30 до часу ночи

https://maps.app.goo.gl/y28mvVVZvYP6xEZXA