Подскажите как быть-апартаменты отказали в ночном заселении. Где можно пребывать после ночного перелета? С 3 х ночи до 7 утра? Только в аэропорту сидеть в кафе или в городе что-то работает? И есть ли прям в аэропорту отель?

Посмотрите на букинге рядом с аэропортом очень много мотелей с круглосуточной стойкой регистрации и даже завтраком с 6 утра. Это самый комфортный отдых лучше чем в аэропорту на железных скамейках. Расстояние обычно 5-10 км от аэропорта.

Прямо в аэропорту нет, есть отели с трансфером за 5€ до отеля First hotel Malpensa там ночевали и утром за авто в Centauro пешком метров 200.