Подскажите, а каким образом несовершеннолетним детям с российскими свидетельствами оформить молдавские свидетельства и гражданство? я гражданин РМ, жена гражданка РФ?

Это называется перерегистрация. Вы с действующим булетином должны подать заявление на перерегистрацию св о браке и о рождении детей. Запись на сайте посольства (если вы в РФ). Перечень документов там же, в разделе "консульские услуги".