Едем в токио, потом на синкансене в другой город. Брони жилья оплачены. Нужно прилагать оплату билетов на синкансен для получения визы? Или можно только жилье и написать в плане поездки, как буду добираться ?

Не надо ни прикладывать, ни писать.

Такая же поездка была перед Новым годом, перезвонили из консульства русская мадам , и спрашивала детали по отелю в другом городе , а про билеты на синкансен точно не надо. Всем успешно визу дали.