Подскажите, пожалуйста, если есть два паспорта , кыргызский и российский , нужно ли делать временную регистрацию в Киргизии?

С паспортом КР нужно делать прописку.

Если вы гражданин России и в паспорте стоит штамп с регистрацией зачем вам делать регистрацию на паспорт другого государства?