С какого порта лучше отплывать в Макао?

С любого, который поближе к вам и смотря куда надо в Макао. Там на обоих островах паромы. Зайдите на сайт turbojet, например, и посмотрите локации откуда можно уехать из Гонконга. Нам было удобно Колун-остров Тайпа, и там и там жили рядом с паромом. Вам может из аэропорта будет удобнее.