У кого есть РВП в Казахстане, скажите, можно ли жить в Алматы, когда работодатель в Астане?

Можно, если это допустимо по трудовому договору.

Сейчас уточнял у миграционки: сообщили, что необходимо проживание в области, в которой зарегистрирована организация. На всякий случай, сообщу, вдруг кому-то будет полезна информация.

Можно. В договоре должна быть прописана дистанционная работа.