У меня открыто ИП в Грузии. В личном кабинете налоговой пришло письмо, мол обнаружили доход не связанный с малым бизнесом (

Если конкретно так, как Вы написали: доход, не связанный с Малым бизнесом, тогда пересмотрите свои документы, чтобы все было в порядке, и уточните в налоговой (можно в онлайн чате поддержки в рабочее время), что конкретно они имеют ввиду и что Вам необходимо предпринять?

Да, и в ТВС для ИП все счета личные. Вы сами разделяете, какой счёт под что использовать. При этом Вы также самостоятельно декларируете свои доходы по бизнесу, независимо от того, куда они приходят. Вносите их в Журнал учёта доходов и затем подсчитываете доход и подаете ежемесячные декларации по Малому статусу, на основании которых и оплачиваете налоги. Если направление не подходит под Малый статус, то по нему ведете отчетность по общей системе налогообложения.