Для учебного ВНЖ Финляндии подходит справка из российского банка, а как при продлении? Можно ли предоставить опять выписку с рос счёта?

Да, можно на российском счете.

Мне тоже кажется, что если это единственный источник, то не продлят.

Основным правилом является возможность использования этих денежных средств. В России и Эстонии есть возможность рубли менять на евро. Это один из аргументов.