Скажите, пожалуйста, надо ли платить пошлину для получения второго загранпаспорта, если он ТМ, а первый даркон? в Израиле

Надо. Если бы получали второй даркон, то тогда не надо платить.

Да нужно , так как это новый документ а не продление даркона.