Стоит ли переехать на пару дней на Себу и оттуда уже брать билет до Манилы. Там вроде Акулы и водопады.

Устанете, слишком много времени добираться с Себу до водопадов, акул и т. д, от 3 часов и больше. Потратитесь на дорогу, логистика не самая приятная, всё это можно найти на Бохоле, кроме каньёнинга.

Можно из Панглао напрямую на пароме с Момо Бич до Ослоба. Если только с акулами поплавать, то ИМХО не имеет смысла в Lila на Бохоле тоже можно хоть и немного дороже. Если водопады (с моей точки зрения не маст си) и Моалбоал с сардинами и черепахами (а вот это уже гораздо интереснее), то тогда да смысл есть. А потом из Себу на самолёте в Манилу. Или ещё куда-нибудь.