Подскажите, как оптимальнее всего летать в ЕС транзитом через Турцию при наличии обоих паспортов? Въезжать в Турцию по загранпаспорту РФ, а выезжать из Турции по лессе-пассе? Так разве можно?

Нельзя. Я как-то при транзите в турции пересекала границу. Так вот «въехала» по новому, а «выезжала» получив багаж опомнившись, что печатями хламить лучше старый паспорт. Так пограничник долго искал печать въезда в страну. Потребовал другой паспорт)