Какие качественные отели в Токио можете порекомендовать? Первый раз буду в Японии и хочется зделать это лучшим знакомсвтом со страной)

Очень сложно не зная ваших запросов) я бы сказала, что рядом с Tokyo station, например, это облегчит поездки в другие города.

Есть на сибуе классные отели, 1000$ за ночь Но в целом можно смотреть отели за 150-200$ за ночь, это будут хорошие отели в центре.

Вообще, зависит от ваших интересов. Потусить - синдзюку, сибуя. Шоппинг - роппонги и гинза. История - асакуса, бункё, уэно. Аниме индустрия - Акихабара.