Насчет обмена валюты, где лучше всего курс? В аэропорту можно рубли на йены поменять? Через баксы и двойную конвертацию наверное менее выгодно?

Рубли в Японии не поменяете.

В России покупаете доллары, в аэропорту меняете на иены - оптимальный вариант.

Везите валюту, в Японии рубли не нужны, если и найдете где, то курс будет хуже двойной конвертации.