Может кто сталкивался или узнавал. Если выехать за пределы ЕС в ожидании ВНЖ с оверстеем, можно ли потом будет податься по воссоединению семьи из РФ или будут проблемы?

Подаваться за пределами Португалии можно - но сложнее и дольше все будет, чем внутри.

Вам при приеме пакета документов выдачи бумагу, подтверждающую ваш статус в качестве человека, ожидающего решения миграционной службы? Если да, то вы можете вернутся в Португалию по ней. Это немного накладно, т. к. не все авиакомпании согласятся посадить вас на рейс, но точно проще, чем потом заново подаваться в РФ.