Кто-нибудь кто летал через Турцию в Испанию, были какие-то вопросы у пограничников?

Именно в Испанию не летал. А вот в Австрию летал и вопросы были только на стройке регистрации от сотрудников авиакомпании: почему лечу в Австрию по французскому шенгену. Достаточно было показать брони авиа Вена - Париж и вопросы отпали.

Год назад летал Тбилиси - Стамбул - Барселона, вопросов не было вообще никаких ни у кого (испанский Шенген).

Не может быть вопросов в принципе. Турция для граждан РФ безвизовая. Если Вы выходите в город, то Вас пропустят. И назад впустят. Если Вы, конечно, не будете гулять более двух месяцев по Турции... .