Мне открыли бизнес счет в БоГ, но на кусь для физического счета получил отказ. Если я переведу со своего другого счета (черногорского) деньги через свифт на счет ип, нужно ли за эти деньги платить налог?

Если это не доход от вашей предпринимательской деятельности как грузинского ИП, то теоретически - не нужно, если в Черногории на них уже уплачен налог ранее и есть документы это подтверждающие. Но! Это же ваш бизнес-счёт, и предполагается, что Вы будете его использовать для доходов по тому бизнесу, под который открывали.