Полгода назад открыл ИП но р/с пока не открыл, нужно ли в личном кабинете грузинской налоговой ставить галочку неактивный.

А при чем здесь счёт к Вашей работе? Грузинское ИП может работать через любые счета Мира в тех банках, которые не запрещают, и через любые платежные системы, например. Статус неактивен относиться именно к деятельности ИП, а не к счету. Если деятельность не осуществляется вообще, то можно перевести ИП в неактивный статус.