Если оборот ИП в год превышает 100к лари, нужно автоматически платить НДС? Заказчик из России.

Если заказчик не грузинский и услуги оказаны удаленно, то нет.

Нет, почитайте статью, кто, когда и как становится плательщиком НДС. Проанализируйте свой кейс на основании представленных данных и НК Грузии и поймете, станете ли Вы плательщиком НДС либо нет. Платится не автоматически, нужно подать заявление на то, чтобы Вас признали плательщиком НДС, если Ваши облагаемые НДС операции превысят 100 к лари/12 мес.